.La faune sauvage a été décimée par l'homme, Dans les cavernes de cette région on peut apprécier une faune variée et un refuge pour plusieurs espèces de chiroptères et d'oiseaux dont le nombre joue un rôle important dans le contrôle de vecteurs nuisibles à l'agriculture et la santé humaine. À l'embouchure même de plusieurs fleuves qui débouchent sur la côte nord on peut voir un des représentants les plus particuliers des vertébrés de Cuba, le matani (ou vache marine) (Trichechus manatus manatus).
Même si on le retrouve à la grandeur du pays, la ranita de Cuba (Eleutherodactylus limbatus) a seulement été aperçue dans quatre provinces, entre autres, celle de la Havane. Elle est parmi les plus petites au monde avec une longueur de 1,2 cm et a 2 doigts libres sans disque digital.